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In einer Kooperation mit der Charité-Universitätsmedizin Berlin ist an der Abteilung Naturheilkunde des Immanuel Krankenhauses Berlin die Stiftungsprofessur für klinische Naturheilkunde des Instituts für Sozialmedizin, Epidemiologie und Gesundheitsökonomie angesiedelt worden.

Inhaber der Stiftungsprofessur ist der Chefarzt der Abteilung, Prof. Dr. med. Andreas Michalsen. Die Stiftungsprofessur ist damit die direkte Nachfolge des bereits 1989 begründeten Lehrstuhls für Naturheilkunde in Berlin der bis 2002 von Prof. Malte Bühring geleitet wurde.

Schwerpunkt der Forschungsaktivitäten sind die Durchführung randomisierter klinischer Studien zur Überprüfung der Wirksamkeit von Naturheilkunde und Komplementärmedizin im Sinne der Evidendence-based-Medicine, sowie die Evaluierung neuer Behandlungskonzepte im Sinne von „proof of concept“-Studien einschließlich von Versorgungsstudien zur Abschätzung der Wirksamkeit unserer Behandlungskonzepte.
Es besteht eine enge Kooperation mit der anderen an der Charité-Universitätsmedizin angesiedelten Stiftungsprofessur für Naturheilkunde (Inhaber Prof. Dr. Benno Brinkhaus). Durch die Anbindung der Stiftungsprofessur an das Institut für Sozialmedizin, Epidemiologie und Gesundheitsökonomie (Direktor Prof. Dr. Willich) am Zentrum 1 der Charité besteht Zugang zur entsprechenden methodologischen Kompetenz dieses Zentrums.

Weitere enge Kooperationen bestehen mit der Universität Duisburg-Essen und dem dort angesiedelten Lehrstuhl für Naturheilkunde und integrative Medizin (Leiter Prof. Dr. Dobos), sowie mit dem Lehrstuhl für integrative Medizin der Universität Witten-Herdecke (Leiter Prof. Dr. Heusser).
Prof. Dr. Michalsen ist zudem Mitglied des Vorstandes der Karl und Veronica Carstens-Stiftung, die wesentlich die Forschung der deutschen Naturheilkunde und Komplementärmedizin fordert.